YOU SAID:

I apologize if I stir up trouble here (I don't mean to), but this has been weighing heavily on my mind and I don't know how to express my feelings of conflict appropriately here.

INTO JAPANESE

ここでトラブルを起こしてしまったことをお詫びしますが（そうするつもりはありません）、これは私の心に重くのしかかっており、ここで自分の葛藤の気持ちを適切に表現する方法がわかりません。

BACK INTO ENGLISH

I apologize for causing trouble here (I'm not going to do that), but this weighs heavily on my heart and I don't know how to properly express my feelings of conflict here. ..

INTO JAPANESE

ここでトラブルを起こしてしまったことをお詫びしますが（そうするつもりはありません）、これは私の心に重くのしかかり、ここで自分の葛藤の気持ちを適切に表現する方法がわかりません。 ..

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I apologize for causing trouble here (I'm not going to do that), but this weighs heavily on my heart and I don't know how to properly express my feelings of conflict here. ..